Bioconductor Case Studies
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Bioconductor software has become a standard tool for the analysis and comprehension of data from high-throughput genomics experiments. Its application spans a broad field of technologies used in contemporary molecular biology. In this volume, the authors present a collection of cases to apply Bioconductor tools in the analysis of microarray gene expression data. Topics covered include: (1) import and preprocessing of data from various sources; (2) statistical modeling of differential gene expression; (3) biological metadata; (4) application of graphs and graph rendering; (5) machine learning for clustering and classification problems; (6) gene set enrichment analysis.
Each chapter of this book describes an analysis of real data using hands-on example driven approaches. Short exercises help in the learning process and invite more advanced considerations of key topics. The book is a dynamic document. All the code shown can be executed on a local computer, and readers are able to reproduce every computation, figure, and table.
| Autor: | Florian Hahne, Wolfgang Huber, Robert Gentleman, Seth Falcon |
|---|---|
| EAN: | 9780387772400 |
| eBook Format: | |
| Sprache: | Englisch |
| Produktart: | eBook |
| Veröffentlichungsdatum: | 09.06.2010 |
| Kategorie: | |
| Schlagworte: | Annotation Bioinformatics Clustering Computational biology Computer Machine learning Microarray Networks biology calculus classification genome modeling |
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